Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLGN4XQ8N0W4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLGN4XQ8N0W4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NLGN4XQ8N0W4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NLGN4XQ8N0W4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms