Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NLGN4XQ8N0W4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NLGN4XQ8N0W4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NLGN4XQ8N0W4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NLGN4XQ8N0W4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NLGN4XQ8N0W4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NLGN4XQ8N0W4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NLGN4XQ8N0W4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLGN4XQ8N0W4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NLGN4XQ8N0W4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NLGN4XQ8N0W4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NLGN4XQ8N0W4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NLGN4XQ8N0W4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NLGN4XQ8N0W4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NLGN4XQ8N0W4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NLGN4XQ8N0W4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NLGN4XQ8N0W4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
NLGN4XQ8N0W4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NLGN4XQ8N0W4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NLGN4XQ8N0W4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NLGN4XQ8N0W4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NLGN4XQ8N0W4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NLGN4XQ8N0W4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NLGN4XQ8N0W4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLGN4XQ8N0W4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NLGN4XQ8N0W4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NLGN4XQ8N0W4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NLGN4XQ8N0W4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NLGN4XQ8N0W4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NLGN4XQ8N0W4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NLGN4XQ8N0W4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NLGN4XQ8N0W4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NLGN4XQ8N0W4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NLGN4XQ8N0W4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NLGN4XQ8N0W4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NLGN4XQ8N0W4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NLGN4XQ8N0W4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NLGN4XQ8N0W4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NLGN4XQ8N0W4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NLGN4XQ8N0W4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NLGN4XQ8N0W4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NLGN4XQ8N0W4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NLGN4XQ8N0W4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NLGN4XQ8N0W4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NLGN4XQ8N0W4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NLGN4XQ8N0W4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NLGN4XQ8N0W4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NLGN4XQ8N0W4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLGN4XQ8N0W4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLGN4XQ8N0W4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NLGN4XQ8N0W4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NLGN4XQ8N0W4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NLGN4XQ8N0W4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NLGN4XQ8N0W4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLGN4XQ8N0W4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NLGN4XQ8N0W4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NLGN4XQ8N0W4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLGN4XQ8N0W4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NLGN4XQ8N0W4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NLGN4XQ8N0W4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLGN4XQ8N0W4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NLGN4XQ8N0W4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLGN4XQ8N0W4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NLGN4XQ8N0W4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NLGN4XQ8N0W4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NLGN4XQ8N0W4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NLGN4XQ8N0W4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NLGN4XQ8N0W4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NLGN4XQ8N0W4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLGN4XQ8N0W4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLGN4XQ8N0W4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLGN4XQ8N0W4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLGN4XQ8N0W4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLGN4XQ8N0W4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLGN4XQ8N0W4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLGN4XQ8N0W4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLGN4XQ8N0W4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLGN4XQ8N0W4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLGN4XQ8N0W4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLGN4XQ8N0W4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLGN4XQ8N0W4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLGN4XQ8N0W4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLGN4XQ8N0W4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLGN4XQ8N0W4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLGN4XQ8N0W4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLGN4XQ8N0W4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLGN4XQ8N0W4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLGN4XQ8N0W4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLGN4XQ8N0W4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLGN4XQ8N0W4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLGN4XQ8N0W4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLGN4XQ8N0W4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLGN4XQ8N0W4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLGN4XQ8N0W4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLGN4XQ8N0W4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NLGN4XQ8N0W4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NLGN4XQ8N0W4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NLGN4XQ8N0W4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms