Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARID3BQ8IVW6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID3BQ8IVW6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARID3BQ8IVW6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms