Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HLA-DQA1Q5Y7H0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HLA-DQA1Q5Y7H0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-DQA1Q5Y7H0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms