Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRAMEF18Q5VWM3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAMEF18Q5VWM3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRAMEF18Q5VWM3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF18Q5VWM3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF18Q5VWM3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF18Q5VWM3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRAMEF18Q5VWM3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms