Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FAM47AQ5JRC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FAM47AQ5JRC9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM47AQ5JRC9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM47AQ5JRC9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms