Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MIA3Q5JRA6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MIA3Q5JRA6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MIA3Q5JRA6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms