Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRA6

MIA3, Transport and Golgi organization protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIA3Q5JRA6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.25
MIA3Q5JRA6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
MIA3Q5JRA6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
MIA3Q5JRA6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
MIA3Q5JRA6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
MIA3Q5JRA6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
MIA3Q5JRA6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
MIA3Q5JRA6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
MIA3Q5JRA6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MIA3Q5JRA6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MIA3Q5JRA6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MIA3Q5JRA6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MIA3Q5JRA6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
MIA3Q5JRA6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MIA3Q5JRA6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MIA3Q5JRA6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MIA3Q5JRA6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MIA3Q5JRA6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MIA3Q5JRA6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MIA3Q5JRA6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
MIA3Q5JRA6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MIA3Q5JRA6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MIA3Q5JRA6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MIA3Q5JRA6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MIA3Q5JRA6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MIA3Q5JRA6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MIA3Q5JRA6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MIA3Q5JRA6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MIA3Q5JRA6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
MIA3Q5JRA6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MIA3Q5JRA6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MIA3Q5JRA6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
MIA3Q5JRA6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
MIA3Q5JRA6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MIA3Q5JRA6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
MIA3Q5JRA6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MIA3Q5JRA6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MIA3Q5JRA6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
MIA3Q5JRA6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MIA3Q5JRA6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
MIA3Q5JRA6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MIA3Q5JRA6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MIA3Q5JRA6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MIA3Q5JRA6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MIA3Q5JRA6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
MIA3Q5JRA6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
MIA3Q5JRA6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MIA3Q5JRA6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
MIA3Q5JRA6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
MIA3Q5JRA6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MIA3Q5JRA6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
MIA3Q5JRA6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
MIA3Q5JRA6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
MIA3Q5JRA6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MIA3Q5JRA6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
MIA3Q5JRA6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
MIA3Q5JRA6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MIA3Q5JRA6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MIA3Q5JRA6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MIA3Q5JRA6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
MIA3Q5JRA6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MIA3Q5JRA6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
MIA3Q5JRA6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
MIA3Q5JRA6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MIA3Q5JRA6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
MIA3Q5JRA6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MIA3Q5JRA6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MIA3Q5JRA6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MIA3Q5JRA6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
MIA3Q5JRA6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
MIA3Q5JRA6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MIA3Q5JRA6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MIA3Q5JRA6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
MIA3Q5JRA6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MIA3Q5JRA6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
MIA3Q5JRA6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MIA3Q5JRA6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MIA3Q5JRA6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MIA3Q5JRA6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MIA3Q5JRA6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MIA3Q5JRA6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MIA3Q5JRA6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MIA3Q5JRA6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MIA3Q5JRA6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MIA3Q5JRA6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MIA3Q5JRA6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MIA3Q5JRA6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MIA3Q5JRA6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MIA3Q5JRA6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MIA3Q5JRA6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MIA3Q5JRA6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MIA3Q5JRA6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
MIA3Q5JRA6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MIA3Q5JRA6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MIA3Q5JRA6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MIA3Q5JRA6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MIA3Q5JRA6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MIA3Q5JRA6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MIA3Q5JRA6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
MIA3Q5JRA6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.8 ms