Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NBPF1Q3BBV0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NBPF1Q3BBV0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
NBPF1Q3BBV0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NBPF1Q3BBV0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NBPF1Q3BBV0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms