Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH1Q15438 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH1Q15438 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH1Q15438 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH1Q15438 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH1Q15438 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH1Q15438 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH1Q15438 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CYTH1Q15438 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CYTH1Q15438 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CYTH1Q15438 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CYTH1Q15438 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYTH1Q15438 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH1Q15438 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms