Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRSF6Q13247 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRSF6Q13247 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SRSF6Q13247 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRSF6Q13247 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
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