Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SRSF6Q13247 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SRSF6Q13247 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SRSF6Q13247 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SRSF6Q13247 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SRSF6Q13247 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SRSF6Q13247 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SRSF6Q13247 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SRSF6Q13247 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SRSF6Q13247 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SRSF6Q13247 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SRSF6Q13247 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SRSF6Q13247 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SRSF6Q13247 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SRSF6Q13247 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SRSF6Q13247 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRSF6Q13247 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SRSF6Q13247 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SRSF6Q13247 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SRSF6Q13247 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRSF6Q13247 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SRSF6Q13247 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SRSF6Q13247 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRSF6Q13247 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SRSF6Q13247 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRSF6Q13247 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SRSF6Q13247 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRSF6Q13247 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SRSF6Q13247 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SRSF6Q13247 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRSF6Q13247 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRSF6Q13247 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SRSF6Q13247 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SRSF6Q13247 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRSF6Q13247 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SRSF6Q13247 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRSF6Q13247 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SRSF6Q13247 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRSF6Q13247 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRSF6Q13247 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SRSF6Q13247 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRSF6Q13247 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRSF6Q13247 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRSF6Q13247 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRSF6Q13247 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRSF6Q13247 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SRSF6Q13247 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRSF6Q13247 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRSF6Q13247 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRSF6Q13247 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SRSF6Q13247 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRSF6Q13247 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRSF6Q13247 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRSF6Q13247 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SRSF6Q13247 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SRSF6Q13247 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRSF6Q13247 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SRSF6Q13247 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRSF6Q13247 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SRSF6Q13247 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRSF6Q13247 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRSF6Q13247 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRSF6Q13247 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRSF6Q13247 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRSF6Q13247 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRSF6Q13247 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRSF6Q13247 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRSF6Q13247 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRSF6Q13247 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRSF6Q13247 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRSF6Q13247 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRSF6Q13247 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRSF6Q13247 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRSF6Q13247 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRSF6Q13247 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRSF6Q13247 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRSF6Q13247 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SRSF6Q13247 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRSF6Q13247 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRSF6Q13247 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRSF6Q13247 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRSF6Q13247 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRSF6Q13247 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRSF6Q13247 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRSF6Q13247 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRSF6Q13247 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRSF6Q13247 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRSF6Q13247 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRSF6Q13247 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRSF6Q13247 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SRSF6Q13247 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SRSF6Q13247 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRSF6Q13247 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRSF6Q13247 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SRSF6Q13247 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRSF6Q13247 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRSF6Q13247 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRSF6Q13247 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SRSF6Q13247 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SRSF6Q13247 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
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