Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDSRQ06136 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDSRQ06136 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDSRQ06136 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms