Protein–RNA interactions for Protein: Q02086

SP2, Transcription factor Sp2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP2Q02086 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP2Q02086 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP2Q02086 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP2Q02086 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP2Q02086 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SP2Q02086 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP2Q02086 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP2Q02086 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP2Q02086 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP2Q02086 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP2Q02086 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP2Q02086 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SP2Q02086 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP2Q02086 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP2Q02086 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP2Q02086 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP2Q02086 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP2Q02086 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SP2Q02086 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP2Q02086 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SP2Q02086 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP2Q02086 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP2Q02086 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP2Q02086 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP2Q02086 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP2Q02086 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SP2Q02086 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP2Q02086 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP2Q02086 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SP2Q02086 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SP2Q02086 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SP2Q02086 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SP2Q02086 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP2Q02086 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP2Q02086 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SP2Q02086 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP2Q02086 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP2Q02086 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP2Q02086 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SP2Q02086 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP2Q02086 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SP2Q02086 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP2Q02086 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP2Q02086 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP2Q02086 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP2Q02086 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SP2Q02086 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP2Q02086 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP2Q02086 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP2Q02086 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP2Q02086 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SP2Q02086 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP2Q02086 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP2Q02086 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP2Q02086 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP2Q02086 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP2Q02086 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP2Q02086 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP2Q02086 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP2Q02086 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP2Q02086 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP2Q02086 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP2Q02086 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP2Q02086 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SP2Q02086 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP2Q02086 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP2Q02086 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SP2Q02086 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP2Q02086 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP2Q02086 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP2Q02086 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP2Q02086 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP2Q02086 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP2Q02086 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SP2Q02086 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP2Q02086 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP2Q02086 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP2Q02086 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP2Q02086 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP2Q02086 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP2Q02086 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP2Q02086 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP2Q02086 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SP2Q02086 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP2Q02086 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP2Q02086 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP2Q02086 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP2Q02086 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP2Q02086 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP2Q02086 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP2Q02086 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP2Q02086 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP2Q02086 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP2Q02086 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP2Q02086 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP2Q02086 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP2Q02086 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP2Q02086 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP2Q02086 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP2Q02086 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms