Protein–RNA interactions for Protein: Q01664

TFAP4, Transcription factor AP-4, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP4Q01664 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TFAP4Q01664 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TFAP4Q01664 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TFAP4Q01664 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFAP4Q01664 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TFAP4Q01664 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFAP4Q01664 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TFAP4Q01664 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TFAP4Q01664 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFAP4Q01664 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFAP4Q01664 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFAP4Q01664 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFAP4Q01664 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFAP4Q01664 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFAP4Q01664 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms