Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D1P54289 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D1P54289 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CACNA2D1P54289 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms