Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP12P39900 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP12P39900 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP12P39900 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP12P39900 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP12P39900 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP12P39900 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP12P39900 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP12P39900 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP12P39900 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP12P39900 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP12P39900 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP12P39900 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP12P39900 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP12P39900 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP12P39900 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP12P39900 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP12P39900 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP12P39900 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP12P39900 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP12P39900 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP12P39900 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP12P39900 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP12P39900 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP12P39900 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP12P39900 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP12P39900 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP12P39900 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP12P39900 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP12P39900 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP12P39900 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP12P39900 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP12P39900 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP12P39900 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP12P39900 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP12P39900 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP12P39900 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP12P39900 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP12P39900 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP12P39900 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP12P39900 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP12P39900 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP12P39900 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP12P39900 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP12P39900 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP12P39900 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP12P39900 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP12P39900 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP12P39900 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP12P39900 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP12P39900 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP12P39900 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP12P39900 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP12P39900 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP12P39900 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP12P39900 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP12P39900 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP12P39900 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP12P39900 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP12P39900 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP12P39900 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP12P39900 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP12P39900 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP12P39900 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP12P39900 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP12P39900 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP12P39900 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP12P39900 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP12P39900 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP12P39900 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP12P39900 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP12P39900 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP12P39900 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP12P39900 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP12P39900 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP12P39900 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP12P39900 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP12P39900 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP12P39900 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP12P39900 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP12P39900 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP12P39900 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP12P39900 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP12P39900 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP12P39900 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP12P39900 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP12P39900 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP12P39900 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP12P39900 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP12P39900 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP12P39900 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP12P39900 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP12P39900 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP12P39900 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP12P39900 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP12P39900 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP12P39900 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP12P39900 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP12P39900 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP12P39900 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms