Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORAP35398 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORAP35398 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORAP35398 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORAP35398 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORAP35398 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RORAP35398 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RORAP35398 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RORAP35398 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RORAP35398 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RORAP35398 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORAP35398 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORAP35398 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORAP35398 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RORAP35398 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORAP35398 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORAP35398 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RORAP35398 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORAP35398 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORAP35398 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORAP35398 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORAP35398 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORAP35398 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORAP35398 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORAP35398 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORAP35398 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORAP35398 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORAP35398 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORAP35398 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORAP35398 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORAP35398 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RORAP35398 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RORAP35398 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RORAP35398 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RORAP35398 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RORAP35398 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RORAP35398 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORAP35398 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORAP35398 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORAP35398 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORAP35398 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORAP35398 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RORAP35398 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RORAP35398 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORAP35398 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RORAP35398 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORAP35398 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORAP35398 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORAP35398 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORAP35398 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORAP35398 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORAP35398 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORAP35398 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORAP35398 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORAP35398 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORAP35398 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORAP35398 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORAP35398 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORAP35398 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORAP35398 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORAP35398 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORAP35398 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORAP35398 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORAP35398 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORAP35398 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORAP35398 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORAP35398 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORAP35398 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORAP35398 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORAP35398 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RORAP35398 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RORAP35398 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORAP35398 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORAP35398 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORAP35398 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RORAP35398 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORAP35398 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RORAP35398 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RORAP35398 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORAP35398 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RORAP35398 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORAP35398 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RORAP35398 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORAP35398 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORAP35398 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORAP35398 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORAP35398 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORAP35398 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RORAP35398 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms