Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPIFP30405 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPIFP30405 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPIFP30405 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPIFP30405 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPIFP30405 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPIFP30405 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPIFP30405 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPIFP30405 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPIFP30405 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPIFP30405 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPIFP30405 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPIFP30405 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPIFP30405 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPIFP30405 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPIFP30405 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPIFP30405 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPIFP30405 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPIFP30405 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPIFP30405 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPIFP30405 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPIFP30405 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPIFP30405 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPIFP30405 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPIFP30405 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPIFP30405 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPIFP30405 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPIFP30405 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPIFP30405 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PPIFP30405 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPIFP30405 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPIFP30405 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PPIFP30405 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PPIFP30405 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPIFP30405 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPIFP30405 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPIFP30405 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPIFP30405 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPIFP30405 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPIFP30405 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPIFP30405 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPIFP30405 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPIFP30405 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PPIFP30405 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPIFP30405 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPIFP30405 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPIFP30405 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPIFP30405 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPIFP30405 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PPIFP30405 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PPIFP30405 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPIFP30405 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPIFP30405 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPIFP30405 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPIFP30405 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPIFP30405 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPIFP30405 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PPIFP30405 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPIFP30405 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPIFP30405 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPIFP30405 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPIFP30405 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPIFP30405 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPIFP30405 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPIFP30405 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPIFP30405 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPIFP30405 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms