Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTBP11277 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTBP11277 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTBP11277 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBP11277 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBP11277 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBP11277 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBP11277 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBP11277 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBP11277 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBP11277 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBP11277 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTBP11277 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBP11277 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBP11277 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBP11277 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBP11277 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBP11277 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBP11277 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBP11277 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBP11277 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTBP11277 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBP11277 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBP11277 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBP11277 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBP11277 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBP11277 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBP11277 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBP11277 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTBP11277 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBP11277 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBP11277 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBP11277 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBP11277 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBP11277 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBP11277 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBP11277 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTBP11277 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTBP11277 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTBP11277 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTBP11277 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTBP11277 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTBP11277 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTBP11277 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTBP11277 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPTBP11277 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTBP11277 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTBP11277 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPTBP11277 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPTBP11277 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTBP11277 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTBP11277 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTBP11277 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPTBP11277 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTBP11277 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPTBP11277 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTBP11277 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTBP11277 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTBP11277 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTBP11277 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTBP11277 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTBP11277 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SPTBP11277 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBP11277 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBP11277 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBP11277 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBP11277 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBP11277 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBP11277 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBP11277 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBP11277 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPTBP11277 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBP11277 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBP11277 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBP11277 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPTBP11277 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBP11277 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBP11277 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBP11277 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SPTBP11277 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBP11277 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SPTBP11277 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBP11277 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBP11277 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBP11277 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBP11277 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBP11277 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBP11277 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBP11277 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBP11277 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBP11277 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBP11277 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPTBP11277 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBP11277 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBP11277 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBP11277 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBP11277 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPTBP11277 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBP11277 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPTBP11277 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms