Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EDN1P05305 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDN1P05305 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDN1P05305 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDN1P05305 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDN1P05305 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDN1P05305 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDN1P05305 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDN1P05305 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDN1P05305 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDN1P05305 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDN1P05305 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDN1P05305 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDN1P05305 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDN1P05305 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDN1P05305 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDN1P05305 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDN1P05305 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDN1P05305 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDN1P05305 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDN1P05305 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDN1P05305 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDN1P05305 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDN1P05305 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDN1P05305 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDN1P05305 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDN1P05305 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDN1P05305 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDN1P05305 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDN1P05305 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDN1P05305 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDN1P05305 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDN1P05305 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDN1P05305 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDN1P05305 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDN1P05305 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDN1P05305 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDN1P05305 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDN1P05305 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDN1P05305 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDN1P05305 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDN1P05305 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDN1P05305 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDN1P05305 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDN1P05305 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDN1P05305 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDN1P05305 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDN1P05305 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDN1P05305 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDN1P05305 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDN1P05305 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EDN1P05305 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDN1P05305 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDN1P05305 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDN1P05305 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDN1P05305 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDN1P05305 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDN1P05305 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDN1P05305 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDN1P05305 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDN1P05305 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDN1P05305 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDN1P05305 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDN1P05305 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDN1P05305 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDN1P05305 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDN1P05305 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDN1P05305 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDN1P05305 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDN1P05305 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDN1P05305 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDN1P05305 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDN1P05305 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDN1P05305 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDN1P05305 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDN1P05305 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EDN1P05305 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDN1P05305 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDN1P05305 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDN1P05305 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDN1P05305 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDN1P05305 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDN1P05305 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDN1P05305 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDN1P05305 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDN1P05305 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDN1P05305 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDN1P05305 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDN1P05305 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDN1P05305 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDN1P05305 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDN1P05305 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EDN1P05305 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDN1P05305 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDN1P05305 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDN1P05305 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDN1P05305 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDN1P05305 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDN1P05305 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDN1P05305 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms