Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
EDN1P05305 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
EDN1P05305 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
EDN1P05305 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
EDN1P05305 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
EDN1P05305 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
EDN1P05305 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
EDN1P05305 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
EDN1P05305 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
EDN1P05305 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
EDN1P05305 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
EDN1P05305 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
EDN1P05305 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
EDN1P05305 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
EDN1P05305 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
EDN1P05305 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
EDN1P05305 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
EDN1P05305 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
EDN1P05305 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
EDN1P05305 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
EDN1P05305 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
EDN1P05305 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
EDN1P05305 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
EDN1P05305 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
EDN1P05305 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
EDN1P05305 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
EDN1P05305 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
EDN1P05305 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
EDN1P05305 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
EDN1P05305 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
EDN1P05305 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EDN1P05305 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
EDN1P05305 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
EDN1P05305 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
EDN1P05305 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
EDN1P05305 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
EDN1P05305 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
EDN1P05305 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
EDN1P05305 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
EDN1P05305 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
EDN1P05305 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
EDN1P05305 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
EDN1P05305 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EDN1P05305 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EDN1P05305 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EDN1P05305 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
EDN1P05305 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
EDN1P05305 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
EDN1P05305 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
EDN1P05305 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
EDN1P05305 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
EDN1P05305 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
EDN1P05305 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
EDN1P05305 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
EDN1P05305 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
EDN1P05305 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
EDN1P05305 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDN1P05305 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
EDN1P05305 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
EDN1P05305 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
EDN1P05305 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
EDN1P05305 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
EDN1P05305 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EDN1P05305 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EDN1P05305 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EDN1P05305 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EDN1P05305 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
EDN1P05305 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
EDN1P05305 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
EDN1P05305 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
EDN1P05305 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EDN1P05305 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
EDN1P05305 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
EDN1P05305 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
EDN1P05305 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
EDN1P05305 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
EDN1P05305 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EDN1P05305 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
EDN1P05305 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDN1P05305 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
EDN1P05305 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
EDN1P05305 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EDN1P05305 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
EDN1P05305 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
EDN1P05305 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
EDN1P05305 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
EDN1P05305 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
EDN1P05305 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
EDN1P05305 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
EDN1P05305 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
EDN1P05305 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
EDN1P05305 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
EDN1P05305 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
EDN1P05305 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
EDN1P05305 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
EDN1P05305 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
EDN1P05305 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
EDN1P05305 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
EDN1P05305 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EDN1P05305 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms