Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EGFRP00533 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EGFRP00533 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EGFRP00533 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EGFRP00533 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EGFRP00533 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EGFRP00533 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EGFRP00533 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EGFRP00533 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EGFRP00533 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EGFRP00533 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EGFRP00533 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EGFRP00533 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EGFRP00533 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EGFRP00533 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EGFRP00533 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EGFRP00533 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EGFRP00533 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EGFRP00533 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EGFRP00533 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EGFRP00533 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EGFRP00533 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EGFRP00533 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EGFRP00533 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EGFRP00533 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EGFRP00533 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EGFRP00533 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EGFRP00533 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EGFRP00533 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EGFRP00533 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EGFRP00533 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EGFRP00533 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EGFRP00533 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EGFRP00533 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EGFRP00533 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EGFRP00533 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EGFRP00533 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EGFRP00533 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EGFRP00533 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
EGFRP00533 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EGFRP00533 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EGFRP00533 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EGFRP00533 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EGFRP00533 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EGFRP00533 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EGFRP00533 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EGFRP00533 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EGFRP00533 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EGFRP00533 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EGFRP00533 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EGFRP00533 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EGFRP00533 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EGFRP00533 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EGFRP00533 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EGFRP00533 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EGFRP00533 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EGFRP00533 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EGFRP00533 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EGFRP00533 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EGFRP00533 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EGFRP00533 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EGFRP00533 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
EGFRP00533 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EGFRP00533 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EGFRP00533 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EGFRP00533 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EGFRP00533 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EGFRP00533 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EGFRP00533 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
EGFRP00533 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EGFRP00533 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EGFRP00533 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EGFRP00533 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EGFRP00533 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
EGFRP00533 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EGFRP00533 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EGFRP00533 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EGFRP00533 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EGFRP00533 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EGFRP00533 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
EGFRP00533 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EGFRP00533 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
EGFRP00533 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EGFRP00533 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EGFRP00533 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EGFRP00533 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EGFRP00533 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EGFRP00533 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EGFRP00533 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EGFRP00533 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EGFRP00533 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EGFRP00533 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EGFRP00533 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EGFRP00533 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
EGFRP00533 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EGFRP00533 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EGFRP00533 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EGFRP00533 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EGFRP00533 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EGFRP00533 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms