Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.23
SOGA1O94964 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
SOGA1O94964 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC41.32■■■■■ 4.21
SOGA1O94964 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.29■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC41.28■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
SOGA1O94964 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC41.21■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.19
SOGA1O94964 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
SOGA1O94964 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC41.19■■■■■ 4.18
SOGA1O94964 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
SOGA1O94964 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SOGA1O94964 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
SOGA1O94964 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
SOGA1O94964 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms