Protein–RNA interactions for Protein: C9JQI7

TMEM232, Transmembrane protein 232, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM232C9JQI7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TMEM232C9JQI7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TMEM232C9JQI7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMEM232C9JQI7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms