Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM221AA4D161 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM221AA4D161 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM221AA4D161 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM221AA4D161 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM221AA4D161 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM221AA4D161 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM221AA4D161 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM221AA4D161 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM221AA4D161 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM221AA4D161 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM221AA4D161 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM221AA4D161 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM221AA4D161 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM221AA4D161 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM221AA4D161 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM221AA4D161 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM221AA4D161 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM221AA4D161 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM221AA4D161 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM221AA4D161 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM221AA4D161 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM221AA4D161 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM221AA4D161 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM221AA4D161 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM221AA4D161 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM221AA4D161 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM221AA4D161 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM221AA4D161 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM221AA4D161 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM221AA4D161 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM221AA4D161 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM221AA4D161 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM221AA4D161 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms