Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 NINL-204ENST00000461642 594 ntTSL 314.77□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-208ENST00000638481 2050 ntTSL 514.72□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.057e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-220ENST00000552542 828 ntTSL 514.69□□□□□ -0.067e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 TAF1C-212ENST00000564774 4637 ntTSL 214.68□□□□□ -0.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.067e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-10■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.077e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BRAT1-203ENST00000467558 4440 ntTSL 514.57□□□□□ -0.087e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 NOP2-205ENST00000536124 689 ntTSL 514.56□□□□□ -0.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CARHSP1-213ENST00000569398 442 ntTSL 214.53□□□□□ -0.087e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC011530.1-203ENST00000597712 432 ntTSL 214.52□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KCTD20-207ENST00000481911 1494 ntTSL 214.47□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SSBP4-214ENST00000607020 504 ntTSL 314.47□□□□□ -0.099e-7■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.097e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.17e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-214ENST00000638845 2010 ntTSL 514.34□□□□□ -0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-213ENST00000638834 856 ntTSL 514.34□□□□□ -0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LRRFIP1-210ENST00000474195 1957 ntTSL 214.34□□□□□ -0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PRDM15-206ENST00000447016 4992 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.117e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-220ENST00000587881 1984 ntTSL 514.33□□□□□ -0.127e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.127e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MAP3K4-207ENST00000490904 5451 ntTSL 1 (best)14.28□□□□□ -0.127e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.137e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.147e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-15■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.167e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ST5-212ENST00000526701 1440 ntTSL 1 (best)14.07□□□□□ -0.167e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 SDC1-204ENST00000429035 646 ntTSL 314.04□□□□□ -0.167e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.173e-9■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.177e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 513.93□□□□□ -0.187e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.185e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PLCG1-215ENST00000608689 969 ntTSL 513.92□□□□□ -0.181e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 C3orf35-207ENST00000466204 1398 ntTSL 1 (best)13.88□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BCAS4-203ENST00000445038 365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.88□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.86□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ARHGEF7-211ENST00000466143 1681 ntTSL 513.85□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-213ENST00000550543 558 ntTSL 513.85□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-239ENST00000640463 3133 ntTSL 513.84□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CARHSP1-209ENST00000567626 350 ntTSL 513.79□□□□□ -0.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TIMM44-209ENST00000599650 921 ntTSL 213.79□□□□□ -0.27e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 C3orf35-208ENST00000481400 1495 ntTSL 1 (best)13.77□□□□□ -0.217e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSNARE1-203ENST00000518928 940 ntTSL 313.75□□□□□ -0.217e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-210ENST00000638664 2793 ntTSL 513.74□□□□□ -0.217e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCBP2-205ENST00000428425 2220 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.227e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CDK12-209ENST00000584632 4165 ntTSL 513.61□□□□□ -0.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-201ENST00000374919 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.237e-6■■■■■ 27.5
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