RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599650.1

TIMM44-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM44, Length 921 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-209ENST00000599650 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.95■■■□□ 2.87
TIMM44-209ENST00000599650 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.27■■■□□ 2.28
TIMM44-209ENST00000599650 ABCC9O60706 1549 aa29.25■■■□□ 2.27
TIMM44-209ENST00000599650 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.89■■■□□ 2.06
TIMM44-209ENST00000599650 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.82■■■□□ 2.04
TIMM44-209ENST00000599650 NACADO15069 1562 aa27.71■■■□□ 2.03
TIMM44-209ENST00000599650 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.4■■□□□ 1.98
TIMM44-209ENST00000599650 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
TIMM44-209ENST00000599650 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TIMM44-209ENST00000599650 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.26■■□□□ 1.95
TIMM44-209ENST00000599650 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.16■■□□□ 1.94
TIMM44-209ENST00000599650 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.03■■□□□ 1.92
TIMM44-209ENST00000599650 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.02■■□□□ 1.92
TIMM44-209ENST00000599650 SCRIBQ14160 1630 aa26.85■■□□□ 1.89
TIMM44-209ENST00000599650 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.64■■□□□ 1.86
TIMM44-209ENST00000599650 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
TIMM44-209ENST00000599650 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.33■■□□□ 1.81
TIMM44-209ENST00000599650 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.3■■□□□ 1.8
TIMM44-209ENST00000599650 NCAPD3P42695 1498 aa25.65■■□□□ 1.7
TIMM44-209ENST00000599650 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.63■■□□□ 1.69
TIMM44-209ENST00000599650 SMARCA4P51532 1647 aa25.59■■□□□ 1.69
TIMM44-209ENST00000599650 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
TIMM44-209ENST00000599650 SMARCA2P51531 1590 aa25.5■■□□□ 1.67
TIMM44-209ENST00000599650 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.43■■□□□ 1.66
TIMM44-209ENST00000599650 HMGXB3Q12766 1538 aa25.41■■□□□ 1.66
TIMM44-209ENST00000599650 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
TIMM44-209ENST00000599650 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.31■■□□□ 1.64
TIMM44-209ENST00000599650 ERCC6Q03468 1493 aa25.21■■□□□ 1.63
TIMM44-209ENST00000599650 NESP48681 1621 aa25.19■■□□□ 1.62
TIMM44-209ENST00000599650 WIZO95785 1651 aa25.06■■□□□ 1.6
TIMM44-209ENST00000599650 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TIMM44-209ENST00000599650 CUX2O14529 1486 aa25■■□□□ 1.59
TIMM44-209ENST00000599650 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.93■■□□□ 1.58
TIMM44-209ENST00000599650 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.93■■□□□ 1.58
TIMM44-209ENST00000599650 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.88■■□□□ 1.57
TIMM44-209ENST00000599650 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TIMM44-209ENST00000599650 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.78■■□□□ 1.56
TIMM44-209ENST00000599650 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TIMM44-209ENST00000599650 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.7■■□□□ 1.54
TIMM44-209ENST00000599650 CFTRP13569 1480 aa24.66■■□□□ 1.54
TIMM44-209ENST00000599650 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.64■■□□□ 1.54
TIMM44-209ENST00000599650 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.62■■□□□ 1.53
TIMM44-209ENST00000599650 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.59■■□□□ 1.53
TIMM44-209ENST00000599650 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.57■■□□□ 1.52
TIMM44-209ENST00000599650 WDR62O43379 1518 aa24.53■■□□□ 1.52
TIMM44-209ENST00000599650 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
TIMM44-209ENST00000599650 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TIMM44-209ENST00000599650 TOPBP1Q92547 1522 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMM44-209ENST00000599650 PRDM2Q13029 1718 aa24.15■■□□□ 1.46
TIMM44-209ENST00000599650 IFT140Q96RY7 1462 aa24.1■■□□□ 1.45
TIMM44-209ENST00000599650 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TIMM44-209ENST00000599650 ABCC8Q09428 1581 aa24.08■■□□□ 1.45
TIMM44-209ENST00000599650 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.05■■□□□ 1.44
TIMM44-209ENST00000599650 OSCARQ8IYS5 282 aa24.02■■□□□ 1.44
TIMM44-209ENST00000599650 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
TIMM44-209ENST00000599650 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.423e-8■■■■□ 23.1
TIMM44-209ENST00000599650 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.91■■□□□ 1.42
TIMM44-209ENST00000599650 SOGA1O94964 1423 aa23.89■■□□□ 1.41
TIMM44-209ENST00000599650 TRIM41Q8WV44 630 aa23.88■■□□□ 1.41
TIMM44-209ENST00000599650 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
TIMM44-209ENST00000599650 CUX1P39880 1505 aa23.85■■□□□ 1.41
TIMM44-209ENST00000599650 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
TIMM44-209ENST00000599650 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.85■■□□□ 1.41
TIMM44-209ENST00000599650 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
TIMM44-209ENST00000599650 FBLN2P98095 1184 aa23.78■■□□□ 1.4
TIMM44-209ENST00000599650 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.64■■□□□ 1.38
TIMM44-209ENST00000599650 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
TIMM44-209ENST00000599650 GRIN2BQ13224 1484 aa23.61■■□□□ 1.37
TIMM44-209ENST00000599650 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
TIMM44-209ENST00000599650 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.56■■□□□ 1.36
TIMM44-209ENST00000599650 WDR97A6NE52 1622 aa23.56■■□□□ 1.36
TIMM44-209ENST00000599650 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.56■■□□□ 1.36
TIMM44-209ENST00000599650 ARHGEF11O15085 1522 aa23.55■■□□□ 1.36
TIMM44-209ENST00000599650 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
TIMM44-209ENST00000599650 CHD1O14646 1710 aa23.54■■□□□ 1.36
TIMM44-209ENST00000599650 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.53■■□□□ 1.36
TIMM44-209ENST00000599650 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.53■■□□□ 1.36
TIMM44-209ENST00000599650 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.53■■□□□ 1.36
TIMM44-209ENST00000599650 SYNJ1O43426 1573 aa23.51■■□□□ 1.35
TIMM44-209ENST00000599650 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.49■■□□□ 1.35
TIMM44-209ENST00000599650 SYNJ2O15056 1496 aa23.49■■□□□ 1.35
TIMM44-209ENST00000599650 TOP2BQ02880 1626 aa23.48■■□□□ 1.35
TIMM44-209ENST00000599650 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.44■■□□□ 1.34
TIMM44-209ENST00000599650 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.43■■□□□ 1.34
TIMM44-209ENST00000599650 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.38■■□□□ 1.33
TIMM44-209ENST00000599650 ARAP1Q96P48 1450 aa23.36■■□□□ 1.33
TIMM44-209ENST00000599650 PBRM1Q86U86 1689 aa23.36■■□□□ 1.33
TIMM44-209ENST00000599650 GRIN2AQ12879 1464 aa23.3■■□□□ 1.32
TIMM44-209ENST00000599650 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.28■■□□□ 1.32
TIMM44-209ENST00000599650 ADAMTS12P58397 1594 aa23.27■■□□□ 1.32
TIMM44-209ENST00000599650 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.23■■□□□ 1.31
TIMM44-209ENST00000599650 NUP160Q12769 1436 aa23.21■■□□□ 1.31
TIMM44-209ENST00000599650 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.17■■□□□ 1.3
TIMM44-209ENST00000599650 CEP170Q5SW79 1584 aa23.17■■□□□ 1.3
TIMM44-209ENST00000599650 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
TIMM44-209ENST00000599650 KIF27Q86VH2 1401 aa23.14■■□□□ 1.29
TIMM44-209ENST00000599650 IGF1RP08069 1367 aa23.14■■□□□ 1.29
TIMM44-209ENST00000599650 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.1■■□□□ 1.29
TIMM44-209ENST00000599650 JPH4Q96JJ6 628 aa23.05■■□□□ 1.28
TIMM44-209ENST00000599650 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms