Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRC8EQ6NSJ5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms