Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
V9GY05 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GY05 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GY05 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GY05 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GY05 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GY05 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GY05 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GY05 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GY05 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
V9GY05 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
V9GY05 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
V9GY05 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms