Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CALB2P22676 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms