Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S1Q92572 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms