RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.21■■■■■ 4.19
IMP4-201ENST00000259239 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.18■■■■□ 3.38
IMP4-201ENST00000259239 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
IMP4-201ENST00000259239 ABCC9O60706 1549 aa34.43■■■■□ 3.1
IMP4-201ENST00000259239 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.07■■■■□ 3.04
IMP4-201ENST00000259239 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.07■■■■□ 3.04
IMP4-201ENST00000259239 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.78■■■■□ 3
IMP4-201ENST00000259239 NACADO15069 1562 aa33.7■■■□□ 2.99
IMP4-201ENST00000259239 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.52■■■□□ 2.96
IMP4-201ENST00000259239 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.36■■■□□ 2.93
IMP4-201ENST00000259239 SCRIBQ14160 1630 aa33.21■■■□□ 2.91
IMP4-201ENST00000259239 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.95■■■□□ 2.87
IMP4-201ENST00000259239 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.53■■■□□ 2.8
IMP4-201ENST00000259239 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.35■■■□□ 2.77
IMP4-201ENST00000259239 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.04■■■□□ 2.72
IMP4-201ENST00000259239 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
IMP4-201ENST00000259239 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
IMP4-201ENST00000259239 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.83■■■□□ 2.69
IMP4-201ENST00000259239 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
IMP4-201ENST00000259239 SMARCA4P51532 1647 aa31.8■■■□□ 2.68
IMP4-201ENST00000259239 WIZO95785 1651 aa31.61■■■□□ 2.65
IMP4-201ENST00000259239 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
IMP4-201ENST00000259239 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.4■■■□□ 2.62
IMP4-201ENST00000259239 SMARCA2P51531 1590 aa31.3■■■□□ 2.6
IMP4-201ENST00000259239 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.29■■■□□ 2.6
IMP4-201ENST00000259239 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
IMP4-201ENST00000259239 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.19■■■□□ 2.58
IMP4-201ENST00000259239 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
IMP4-201ENST00000259239 NCAPD3P42695 1498 aa31.06■■■□□ 2.56
IMP4-201ENST00000259239 HMGXB3Q12766 1538 aa31.06■■■□□ 2.56
IMP4-201ENST00000259239 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.87■■■□□ 2.53
IMP4-201ENST00000259239 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.61■■■□□ 2.49
IMP4-201ENST00000259239 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.34■■■□□ 2.45
IMP4-201ENST00000259239 CFTRP13569 1480 aa30.3■■■□□ 2.44
IMP4-201ENST00000259239 PRDM2Q13029 1718 aa30.29■■■□□ 2.44
IMP4-201ENST00000259239 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.23■■■□□ 2.43
IMP4-201ENST00000259239 ABCC8Q09428 1581 aa30.17■■■□□ 2.42
IMP4-201ENST00000259239 NESP48681 1621 aa30.14■■■□□ 2.42
IMP4-201ENST00000259239 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.13■■■□□ 2.41
IMP4-201ENST00000259239 TRIM41Q8WV44 630 aa29.99■■■□□ 2.39
IMP4-201ENST00000259239 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
IMP4-201ENST00000259239 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.94■■■□□ 2.38
IMP4-201ENST00000259239 SYNJ1O43426 1573 aa29.92■■■□□ 2.38
IMP4-201ENST00000259239 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.87■■■□□ 2.37
IMP4-201ENST00000259239 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.84■■■□□ 2.37
IMP4-201ENST00000259239 TOP2BQ02880 1626 aa29.81■■■□□ 2.36
IMP4-201ENST00000259239 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.81■■■□□ 2.36
IMP4-201ENST00000259239 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.8■■■□□ 2.36
IMP4-201ENST00000259239 CUX1P39880 1505 aa29.8■■■□□ 2.36
IMP4-201ENST00000259239 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.65■■■□□ 2.34
IMP4-201ENST00000259239 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
IMP4-201ENST00000259239 TOPBP1Q92547 1522 aa29.59■■■□□ 2.33
IMP4-201ENST00000259239 ERCC6Q03468 1493 aa29.56■■■□□ 2.32
IMP4-201ENST00000259239 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.52■■■□□ 2.32
IMP4-201ENST00000259239 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.52■■■□□ 2.32
IMP4-201ENST00000259239 SOGA1O94964 1423 aa29.48■■■□□ 2.31
IMP4-201ENST00000259239 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
IMP4-201ENST00000259239 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
IMP4-201ENST00000259239 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
IMP4-201ENST00000259239 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.4■■■□□ 2.3
IMP4-201ENST00000259239 WDR62O43379 1518 aa29.4■■■□□ 2.3
IMP4-201ENST00000259239 EEA1Q15075 1411 aa29.33■■■□□ 2.29
IMP4-201ENST00000259239 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.31■■■□□ 2.28
IMP4-201ENST00000259239 WDR97A6NE52 1622 aa29.28■■■□□ 2.28
IMP4-201ENST00000259239 CUX2O14529 1486 aa29.24■■■□□ 2.27
IMP4-201ENST00000259239 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.24■■■□□ 2.27
IMP4-201ENST00000259239 KIF27Q86VH2 1401 aa29.22■■■□□ 2.27
IMP4-201ENST00000259239 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
IMP4-201ENST00000259239 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.17■■■□□ 2.26
IMP4-201ENST00000259239 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.16■■■□□ 2.26
IMP4-201ENST00000259239 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.08■■■□□ 2.25
IMP4-201ENST00000259239 IFT140Q96RY7 1462 aa29.08■■■□□ 2.25
IMP4-201ENST00000259239 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.08■■■□□ 2.25
IMP4-201ENST00000259239 KIF21BO75037 1637 aa29.05■■■□□ 2.24
IMP4-201ENST00000259239 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
IMP4-201ENST00000259239 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.98■■■□□ 2.23
IMP4-201ENST00000259239 IGF1RP08069 1367 aa28.97■■■□□ 2.23
IMP4-201ENST00000259239 PBRM1Q86U86 1689 aa28.96■■■□□ 2.23
IMP4-201ENST00000259239 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
IMP4-201ENST00000259239 GOLGA3Q08378 1498 aa28.94■■■□□ 2.22
IMP4-201ENST00000259239 PRXQ9BXM0 1461 aa28.94■■■□□ 2.22
IMP4-201ENST00000259239 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
IMP4-201ENST00000259239 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.225e-7■■■■■ 37.2
IMP4-201ENST00000259239 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.91■■■□□ 2.22
IMP4-201ENST00000259239 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.9■■■□□ 2.22
IMP4-201ENST00000259239 CUL7Q14999 1698 aa28.89■■■□□ 2.22
IMP4-201ENST00000259239 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.83■■■□□ 2.21
IMP4-201ENST00000259239 GRIN2BQ13224 1484 aa28.8■■■□□ 2.2
IMP4-201ENST00000259239 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
IMP4-201ENST00000259239 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.74■■■□□ 2.19
IMP4-201ENST00000259239 ADAMTS12P58397 1594 aa28.73■■■□□ 2.19
IMP4-201ENST00000259239 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.67■■■□□ 2.18
IMP4-201ENST00000259239 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.64■■■□□ 2.18
IMP4-201ENST00000259239 CEP162Q5TB80 1403 aa28.61■■■□□ 2.17
IMP4-201ENST00000259239 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
IMP4-201ENST00000259239 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.58■■■□□ 2.17
IMP4-201ENST00000259239 SYNJ2O15056 1496 aa28.5■■■□□ 2.15
IMP4-201ENST00000259239 GRIN2AQ12879 1464 aa28.47■■■□□ 2.15
IMP4-201ENST00000259239 CLIP1P30622 1438 aa28.46■■■□□ 2.15
IMP4-201ENST00000259239 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
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