Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 115.6
SF3B1O75533 SMYD3-210ENST00000470863 983 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 115.6
SF3B1O75533 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 525.83■■□□□ 1.732e-6■■■■■ 115.5
SF3B1O75533 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 115.5
SF3B1O75533 MACF1-227ENST00000524432 4338 ntTSL 517.47■□□□□ 0.393e-6■■■■■ 115.5
SF3B1O75533 AHDC1-205ENST00000490295 511 ntTSL 517.59■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 115.4
SF3B1O75533 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 115.4
SF3B1O75533 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.131e-6■■■■■ 115.4
SF3B1O75533 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.463e-6■■■■■ 115.4
SF3B1O75533 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 115.4
SF3B1O75533 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 115.4
SF3B1O75533 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 115.4
SF3B1O75533 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -03e-6■■■■■ 115.4
SF3B1O75533 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 115.4
SF3B1O75533 ANXA11-206ENST00000447489 750 ntTSL 316.83■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 115.4
SF3B1O75533 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.587e-6■■■■■ 115.3
SF3B1O75533 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.023e-6■■■■■ 115.2
SF3B1O75533 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 115.2
SF3B1O75533 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 115.2
SF3B1O75533 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.75e-6■■■■■ 115.2
SF3B1O75533 ZNF653-205ENST00000590548 2016 ntTSL 224.92■■□□□ 1.585e-6■■■■■ 115.2
SF3B1O75533 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.515e-6■■■■■ 115.2
SF3B1O75533 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 115.1
SF3B1O75533 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 115.1
SF3B1O75533 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 115.1
SF3B1O75533 PDIA5-203ENST00000469649 722 ntTSL 54.89□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 115.1
SF3B1O75533 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.123e-7■■■■■ 115.1
SF3B1O75533 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 115.1
SF3B1O75533 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 115.1
SF3B1O75533 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 115.1
SF3B1O75533 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 115.1
SF3B1O75533 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 115.1
SF3B1O75533 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.624e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.944e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.015e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 CLPB-205ENST00000535477 2047 ntTSL 519.52■□□□□ 0.715e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 CLPB-206ENST00000535990 2203 ntTSL 218.97■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 ACOT7-205ENST00000377860 1472 ntTSL 1 (best)18.01■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 ACOT7-206ENST00000418124 1564 ntTSL 1 (best)17.1■□□□□ 0.334e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.095e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.445e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 CLPB-203ENST00000437826 3379 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.884e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 115
SF3B1O75533 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.091e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.061e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DMTN-218ENST00000522148 616 ntTSL 525.91■■□□□ 1.744e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.725e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 TBC1D1-209ENST00000446803 1987 ntTSL 224.57■■□□□ 1.525e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.521e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MED16-206ENST00000586342 635 ntTSL 1 (best)24.48■■□□□ 1.518e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-216ENST00000531897 785 ntTSL 524.35■■□□□ 1.498e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.461e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 R3HDM4-202ENST00000586080 537 ntTSL 423.66■■□□□ 1.381e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.348e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PTGES2-212ENST00000496594 2103 ntTSL 523■■□□□ 1.275e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.275e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EPN2-206ENST00000395628 1657 ntTSL 222.9■■□□□ 1.265e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EPN2-214ENST00000577244 561 ntTSL 422.61■■□□□ 1.215e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.28e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.195e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MBOAT7-207ENST00000449249 707 ntTSL 522.36■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EPN2-219ENST00000582234 537 ntTSL 422.31■■□□□ 1.165e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DMTN-211ENST00000518816 997 ntTSL 222.23■■□□□ 1.154e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 RAB3IL1-205ENST00000531922 866 ntTSL 322.08■■□□□ 1.135e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PCSK4-205ENST00000586616 2855 ntTSL 222.01■■□□□ 1.115e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.118e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.045e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EPN2-220ENST00000582659 404 ntTSL 521.41■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EPN2-216ENST00000580579 569 ntTSL 421.41■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EPN2-215ENST00000577692 591 ntTSL 421.41■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EPN2-222ENST00000583197 637 ntTSL 321.41■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 HDAC5-205ENST00000587135 504 ntTSL 221.25■□□□□ 0.995e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ALKBH6-204ENST00000461668 793 ntTSL 521.25■□□□□ 0.995e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ORMDL1-206ENST00000458355 914 ntTSL 321.14■□□□□ 0.978e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ALKBH6-216ENST00000495116 630 ntTSL 221.07■□□□□ 0.965e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 VILL-210ENST00000488209 543 ntTSL 220.99■□□□□ 0.955e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.945e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PTGES2-211ENST00000493205 1514 ntTSL 520.84■□□□□ 0.935e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MBOAT7-206ENST00000437868 2033 ntTSL 1 (best)20.55■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.885e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 THOC7-207ENST00000498422 738 ntTSL 320.53■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 ASPSCR1-220ENST00000585140 447 ntTSL 320.48■□□□□ 0.878e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.848e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 PUF60-217ENST00000531951 973 ntTSL 320.21■□□□□ 0.838e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 EPN2-208ENST00000494192 959 ntTSL 1 (best)20.05■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MMS19-210ENST00000439048 609 ntTSL 520.02■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 SURF6-202ENST00000468290 935 ntTSL 219.94■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MMS19-211ENST00000441194 916 ntTSL 519.87■□□□□ 0.775e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MMS19-208ENST00000437002 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.78■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MMS19-205ENST00000422685 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 519.78■□□□□ 0.765e-7■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 HDAC5-209ENST00000588703 445 ntTSL 319.77■□□□□ 0.765e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.755e-6■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 MED16-208ENST00000592373 927 ntTSL 319.73■□□□□ 0.758e-14■■■■■ 114.9
SF3B1O75533 IRF1-203ENST00000437654 832 ntTSL 319.65■□□□□ 0.748e-14■■■■■ 114.9
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1365.6 ms