RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586342.1

MED16-206, Transcript of mediator complex subunit 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MED16, Length 635 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16-206ENST00000586342 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.94■■■■■ 6.55
MED16-206ENST00000586342 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.28■■■■■ 5.64
MED16-206ENST00000586342 ABCC9O60706 1549 aa49.95■■■■■ 5.59
MED16-206ENST00000586342 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.7■■■■■ 5.23
MED16-206ENST00000586342 NACADO15069 1562 aa47.41■■■■■ 5.18
MED16-206ENST00000586342 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.89■■■■■ 5.1
MED16-206ENST00000586342 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.76■■■■■ 5.08
MED16-206ENST00000586342 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.75■■■■■ 5.07
MED16-206ENST00000586342 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.75■■■■■ 5.07
MED16-206ENST00000586342 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.03
MED16-206ENST00000586342 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.39■■■■■ 5.02
MED16-206ENST00000586342 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.39■■■■■ 5.02
MED16-206ENST00000586342 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.31■■■■■ 5
MED16-206ENST00000586342 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.8■■■■■ 4.92
MED16-206ENST00000586342 SCRIBQ14160 1630 aa45.67■■■■■ 4.9
MED16-206ENST00000586342 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.23■■■■■ 4.83
MED16-206ENST00000586342 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.19■■■■■ 4.82
MED16-206ENST00000586342 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.01■■■■■ 4.8
MED16-206ENST00000586342 NCAPD3P42695 1498 aa43.75■■■■■ 4.59
MED16-206ENST00000586342 SMARCA4P51532 1647 aa43.66■■■■■ 4.58
MED16-206ENST00000586342 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.62■■■■■ 4.57
MED16-206ENST00000586342 SMARCA2P51531 1590 aa43.52■■■■■ 4.56
MED16-206ENST00000586342 HMGXB3Q12766 1538 aa43.52■■■■■ 4.56
MED16-206ENST00000586342 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
MED16-206ENST00000586342 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.32■■■■■ 4.52
MED16-206ENST00000586342 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
MED16-206ENST00000586342 CUX2O14529 1486 aa43.12■■■■■ 4.49
MED16-206ENST00000586342 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.09■■■■■ 4.49
MED16-206ENST00000586342 ERCC6Q03468 1493 aa43.08■■■■■ 4.49
MED16-206ENST00000586342 NESP48681 1621 aa42.98■■■■■ 4.47
MED16-206ENST00000586342 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.83■■■■■ 4.45
MED16-206ENST00000586342 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.78■■■■■ 4.44
MED16-206ENST00000586342 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.42
MED16-206ENST00000586342 WIZO95785 1651 aa42.59■■■■■ 4.41
MED16-206ENST00000586342 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.54■■■■■ 4.4
MED16-206ENST00000586342 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.41■■■■■ 4.38
MED16-206ENST00000586342 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.35■■■■■ 4.37
MED16-206ENST00000586342 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.2■■■■■ 4.35
MED16-206ENST00000586342 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.11■■■■■ 4.33
MED16-206ENST00000586342 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
MED16-206ENST00000586342 WDR62O43379 1518 aa42.08■■■■■ 4.33
MED16-206ENST00000586342 CFTRP13569 1480 aa41.97■■■■■ 4.31
MED16-206ENST00000586342 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.94■■■■■ 4.3
MED16-206ENST00000586342 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.9■■■■■ 4.3
MED16-206ENST00000586342 PRDM2Q13029 1718 aa41.7■■■■■ 4.27
MED16-206ENST00000586342 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
MED16-206ENST00000586342 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.53■■■■■ 4.24
MED16-206ENST00000586342 TOPBP1Q92547 1522 aa41.15■■■■■ 4.18
MED16-206ENST00000586342 IFT140Q96RY7 1462 aa41.09■■■■■ 4.17
MED16-206ENST00000586342 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.04■■■■■ 4.16
MED16-206ENST00000586342 ABCC8Q09428 1581 aa41.03■■■■■ 4.16
MED16-206ENST00000586342 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
MED16-206ENST00000586342 OSCARQ8IYS5 282 aa40.94■■■■■ 4.14
MED16-206ENST00000586342 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
MED16-206ENST00000586342 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
MED16-206ENST00000586342 TRIM41Q8WV44 630 aa40.84■■■■■ 4.13
MED16-206ENST00000586342 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
MED16-206ENST00000586342 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.62■■■■■ 4.09
MED16-206ENST00000586342 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.62■■■■■ 4.09
MED16-206ENST00000586342 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.62■■■■■ 4.09
MED16-206ENST00000586342 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.6■■■■■ 4.091e-9■■■■■ 37.7
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MED16-206ENST00000586342 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.51■■■■■ 4.08
MED16-206ENST00000586342 ARHGEF11O15085 1522 aa40.49■■■■■ 4.07
MED16-206ENST00000586342 CUX1P39880 1505 aa40.49■■■■■ 4.07
MED16-206ENST00000586342 WDR97A6NE52 1622 aa40.49■■■■■ 4.07
MED16-206ENST00000586342 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.47■■■■■ 4.07
MED16-206ENST00000586342 SOGA1O94964 1423 aa40.44■■■■■ 4.06
MED16-206ENST00000586342 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
MED16-206ENST00000586342 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.26■■■■■ 4.03
MED16-206ENST00000586342 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
MED16-206ENST00000586342 GRIN2BQ13224 1484 aa40.15■■■■■ 4.02
MED16-206ENST00000586342 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.13■■■■■ 4.01
MED16-206ENST00000586342 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
MED16-206ENST00000586342 FBLN2P98095 1184 aa40.12■■■■■ 4.01
MED16-206ENST00000586342 PBRM1Q86U86 1689 aa40.11■■■■■ 4.01
MED16-206ENST00000586342 ARAP1Q96P48 1450 aa40.1■■■■■ 4.01
MED16-206ENST00000586342 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.07■■■■■ 4.01
MED16-206ENST00000586342 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.06■■■■■ 4
MED16-206ENST00000586342 SYNJ1O43426 1573 aa40.03■■■■■ 4
MED16-206ENST00000586342 SYNJ2O15056 1496 aa40.03■■■■■ 4
MED16-206ENST00000586342 GAPVD1Q14C86 1478 aa40■■■■□ 3.99
MED16-206ENST00000586342 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.95■■■■□ 3.99
MED16-206ENST00000586342 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.95■■■■□ 3.99
MED16-206ENST00000586342 TOP2BQ02880 1626 aa39.91■■■■□ 3.98
MED16-206ENST00000586342 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
MED16-206ENST00000586342 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.82■■■■□ 3.96
MED16-206ENST00000586342 ADAMTS12P58397 1594 aa39.73■■■■□ 3.95
MED16-206ENST00000586342 GRIN2AQ12879 1464 aa39.67■■■■□ 3.94
MED16-206ENST00000586342 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.57■■■■□ 3.93
MED16-206ENST00000586342 CEP170Q5SW79 1584 aa39.57■■■■□ 3.92
MED16-206ENST00000586342 NUP160Q12769 1436 aa39.57■■■■□ 3.92
MED16-206ENST00000586342 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.51■■■■□ 3.92
MED16-206ENST00000586342 SHROOM2Q13796 1616 aa39.46■■■■□ 3.91
MED16-206ENST00000586342 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.46■■■■□ 3.91
MED16-206ENST00000586342 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
MED16-206ENST00000586342 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.19■■■■□ 3.86
MED16-206ENST00000586342 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
MED16-206ENST00000586342 CUL7Q14999 1698 aa39.04■■■■□ 3.84
MED16-206ENST00000586342 KIF27Q86VH2 1401 aa38.98■■■■□ 3.83
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