Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HCN4Q9Y3Q4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HCN4Q9Y3Q4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HCN4Q9Y3Q4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN4Q9Y3Q4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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