Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
SBNO2Q9Y2G9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SBNO2Q9Y2G9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SBNO2Q9Y2G9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SBNO2Q9Y2G9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SBNO2Q9Y2G9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms