Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
C5orf42Q9H799 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C5orf42Q9H799 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C5orf42Q9H799 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C5orf42Q9H799 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
C5orf42Q9H799 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms