Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NLRP1Q9C000 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NLRP1Q9C000 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
NLRP1Q9C000 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
NLRP1Q9C000 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NLRP1Q9C000 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms