Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPS2Q9BXY5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPS2Q9BXY5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPS2Q9BXY5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms