Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPN18Q99952 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPN18Q99952 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPN18Q99952 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPN18Q99952 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms