Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MS4A4AQ96JQ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MS4A4AQ96JQ5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MS4A4AQ96JQ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms