Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DPF3Q92784 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DPF3Q92784 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DPF3Q92784 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DPF3Q92784 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DPF3Q92784 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DPF3Q92784 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DPF3Q92784 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DPF3Q92784 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms