Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBXN4Q92575 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBXN4Q92575 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBXN4Q92575 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBXN4Q92575 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms