Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TMC1Q8TDI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TMC1Q8TDI8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TMC1Q8TDI8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TMC1Q8TDI8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms