Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVJ8

APRG1, AP20 region protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRG1Q8IVJ8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APRG1Q8IVJ8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APRG1Q8IVJ8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APRG1Q8IVJ8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APRG1Q8IVJ8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
APRG1Q8IVJ8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
APRG1Q8IVJ8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
APRG1Q8IVJ8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APRG1Q8IVJ8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
APRG1Q8IVJ8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
APRG1Q8IVJ8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APRG1Q8IVJ8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APRG1Q8IVJ8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APRG1Q8IVJ8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APRG1Q8IVJ8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APRG1Q8IVJ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APRG1Q8IVJ8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms