Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SND1Q7KZF4 TSPAN31-202ENST00000546922 892 ntTSL 310.21□□□□□ -0.777e-8■■■■■ 28.8
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SND1Q7KZF4 PPT1-210ENST00000530704 2340 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 28.3
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SND1Q7KZF4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 28.3
SND1Q7KZF4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 28.3
SND1Q7KZF4 TM9SF1-208ENST00000529332 2107 ntTSL 517.31■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 28.3
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SND1Q7KZF4 AL136295.1-201ENST00000530611 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 28.3
SND1Q7KZF4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.423e-8■■■■■ 28.3
SND1Q7KZF4 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 28.3
SND1Q7KZF4 CD276-206ENST00000559073 1844 ntTSL 1 (best)14.58□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 28.3
SND1Q7KZF4 CD276-212ENST00000561176 640 ntTSL 314.2□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 28.3
SND1Q7KZF4 P4HB-210ENST00000476482 765 ntTSL 1 (best)13.15□□□□□ -0.33e-22■■■■■ 28.3
SND1Q7KZF4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.631e-9■■■■■ 28.3
SND1Q7KZF4 FADS2-203ENST00000355484 2107 ntTSL 213.45□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 28.3
SND1Q7KZF4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 28.2
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SND1Q7KZF4 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.45e-7■■■■■ 28.2
SND1Q7KZF4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.877e-35■■■■■ 28.2
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SND1Q7KZF4 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.217e-35■■■■■ 28.2
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