Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
FGD6Q6ZV73 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
FGD6Q6ZV73 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
FGD6Q6ZV73 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
FGD6Q6ZV73 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms