Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM43BQ6ZT52 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
FAM43BQ6ZT52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FAM43BQ6ZT52 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM43BQ6ZT52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
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