Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNJ1

NBEAL2, Neurobeachin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAL2Q6ZNJ1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NBEAL2Q6ZNJ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NBEAL2Q6ZNJ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NBEAL2Q6ZNJ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NBEAL2Q6ZNJ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NBEAL2Q6ZNJ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NBEAL2Q6ZNJ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NBEAL2Q6ZNJ1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NBEAL2Q6ZNJ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NBEAL2Q6ZNJ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NBEAL2Q6ZNJ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NBEAL2Q6ZNJ1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms